Untuk menjamin terselenggaranya proses penjamin mutu yang berkelanjutan, Lembaga Penjaminan Mutu (LJM) UMS menyelenggarakan Audit Mutu Internal (AMI). AMI Akhir Tahun 2018/2019 kali ini dilaksanakan pada hari Rabu, 14 Agustus 2019 di Ruang Program Studi Pendidikan Matematika. Dua orang auditor ditugaskan oleh LJM, yakni Ir. Haryanto, M.Si. dan Dr. Drs. Kuswaji Dwi Priyono, M.Si. Sedangkan auditi dari Prodi Pendidikan Matematika diwakili oleh Ketua Program Studi, Sekretaris Program Studi 1, Sekretaris Program Studi 2, dan Kepala Laboratorium Komputasi dan Pembelajaran Matematika.
AMI akhir tahun ini meliputi proses audit RPPS dan pengukuran Key Performance Indicator (KPI). Dengan mempertimbangkan hasil monitoring dan evaluasi serta bukti-bukti pendukung, tim auditor menilai Indeks Efektifitas Anggaran sebesar kegiatan RPPS 99,5 dan Nilai Indeks Keterlaksanaan sebesar 98,5.
Dari hasil audit KPI, beberapa indikator seperti indeks publikasi hasil penelitian dosen telah melampaui standar. Namun, publikasi hasil pengabdian kepada masyarakat masih harus ditingkatkan. Selain itu, Prodi Pendidikan Matematika harus memperhatikan indeks luaran penelitian dan pengabdian kepada masyarakat yang belum mencapai standar. Produk penelitian dan pengabdian kepada masyarakat, baik dari dosen maupun mahasiswa harus diarahkan pada pendaftaran paten atau hak cipta.