Audit Mutu Internal (AMI) dilaksanakan untuk menjamin terselenggaranya proses penjaminan mutu yang berkelanjutan. Karena pandemi Covid-19, AMI Akhir Tahun 2019/2020 yang dilaksanakan pada Senin, 26 Oktober 2020 dilakukan secara daring melalui Zoom Meeting. LJM menugaskan dua auditor yakni Sulastri, S.Kp., M.Kes. dan Drs. Yuli Tri Cahyono, M.M. Auditi dari Prodi Pendidikan Matematika diwakili oleh Ketua Program Studi, Sekretaris Program Studi 1, Sekretaris Program Studi 2, dan Kepala Laboratorium Komputasi dan Pembelajaran Matematika.
Ruang lingkup AMI semester genap tahun 2019/2020 ini meliputi Sistem Manajemen Mutu dan pengukuran KPI, serta kinerja kegiatan RPPS Tahun 2019/2020. Dari Berita Acara AMI, kinerja kegiatan RPPS tercatat nilai Indeks Efektifitas Anggaran sebesar kegiatan RPPS 100,0 dan Nilai Indeks Keterlaksanaan sebesar 100,0. Kegiatan RPPS terlaksana dan terdokumentasi dengan baik.
Hasil pengukuran KPI menunjukkan beberapa indikator telah mencapai dan melampui standar, misalnya pada IPK lulusan, kesesuaian bidang kerja, keberhasil studi, prestasi akademik, publikasi ilmiah dosen, dan lain-lain. Namun, beberapa indikator tampak belum mencapai standar, salah satunya prestasi non akademik mahasiswa.
Prodi Pendidikan Matematika perlu menggenjot prestasi non akademik mahasiswa khususnya pada ajang-ajang internasional. Upaya ini dapat dilakukan dengan kerjasama dengan HMP, Wakil Dekan III FKIP UMS, dan Biro Kemahasiswaan UMS untuk mengoptimalkan potensi mahasiswa melalui Unit Kegiatan Mahasiswa. Selain itu, indeks mahasiswa asing juga masih rendah. Prodi harus bekerja sama dengan Biro Kerjasama dan Urusan Internasional (BKUI) untuk mempromosikan prodi di tingkat internasional.